Yeditepe Üniversitesi Sürekli Eğitim Merkezi
Moleküler Tasarım ve Modelleme Okulu
     05/10/2019 - 27/10/2019
     8 Gün / 64 Saat
     Cumartesi ve Pazar
     09:00 - 18:00
     Yeditepe Üniversitesi 26 Ağustos Yerleşimi
     500 TL
Eğitim Amacı
Moleküler tasarım ve modelleme tekniklerinin yüksek başarılı sistemler üzerindeki çeşitli uygulamalarıyla katılımcıların bu konudaki bilgi ve beceri seviyesinin yükseltilmesidir.
Kimler Katılabilir

İlgi duyan herkesin katılımına açıktır.
Kayıt için ; https://forms.gle/9BgH8BUEvbvPd3KX7 

Kontenjan
Min: 10 Max: 20
Son Başvuru Tarihi
02/10/2019
Eğitim İçeriği
  • Modül 1 : Yüksek Başarımlı Hesaplamalar (YBH) ve Süper Bilgisayarların Bileşenleri

  • FLOPS

  • Top500 listesi

  • Bir YBH sunucusunun kişisel bilgisayarla karşılaştırılması

  • Hafıza hiyerarşisi

  • Network

  • Dağıtık/paylaşımlı bellek

  • Paralel dosya sistemi

  • Kuyruk sistemi

  • YBH merkezleri

  • Modül 2 : Kuantum Mekaniksel (QM) Hesaplamalar

  • Theoretical Background: A brief introduction to theoretical methods including Hartree-Fock Theory, Density Functional Theory and Semi-empirical methods

  • Getting Started with Calculations: Building molecules, generating input files and overview of output files

  • Geometry Optimizations: What is the preferred structure of molecules?

  • Searching Conformational Space: Is the structure a local or global minima on the potential energy surface?

  • Locating Transition Structures

  • Following Reaction Paths: Is the optimized transition structure connecting the reactants and products?

  • Visualizing Surfaces to Understand Reactivity: Inspecting molecular orbitals and the electrostatic potential

  • Population Analysis: Where really are these electrons?

  • Thermochemistry: Connecting experiment and theory

  • Modeling in Solution: How does the solvent affect molecular systems?

  • Basis Sets for Molecular Systems: Basis set superposition error (BSSE) and effective core potentials (ECP)

  • Special Topic: Quantum Cluster Approach

  • Rendering Images for Publication

  • Modül 3 : Moleküler Dinamik Simülasyonları

  • ž   Molecular Mechanics

    ž   Force Fields

    ž   Ensembles

    ž   Ergodic Hypothesis

    ž   Molecular Dynamics Basics: Algorithms, Parameters, Approximations, Trajectory Analysis

    ž   Ab initio MD

     

  • Modül 4 : Moleküler Tasarım

  • Structural/Fragment-based molecule design

  • Pharmacophore based molecule discovery

  • Computational Identification of Potential (Organo)catalysts (CIPOC)

  • Identification of Promiscuous enzyme activity and enzyme re-design

Eğitim sonunda her modül için sertifika verilecektir.

 

Eğitim bedeli 1 modül için 500 TL'dir. 

4 Modül için eğitim bedeli 2.000 TL'dir. 

Öğrencilere %50 indirim yapılacaktır. 

Ücretini ödeyen katılımcılarımızın kayıt işlemini tamamlamak için dekontlarını 7tepe.motmo@gmail.com adresine göndermeleri gerekmektedir